intTypePromotion=1
zunia.vn Tuyển sinh 2024 dành cho Gen-Z zunia.vn zunia.vn
ADSENSE
 » 
 » 

BÁO CÁO " ĐÁNH GIÁ ĐỘ THUẦN 10 GIỐNG TẰM (BOMBYX MORY L.) BẰNG CHỈ THỊ RAPD "

Chia sẻ: Vồng Cầu | Ngày: | Loại File: PDF | Số trang:8

Thêm vào BST
Báo xấu
69
lượt xem 3
download
 
  Download Vui lòng tải xuống để xem tài liệu đầy đủ

Trong nghiên cứu này, mười giống tằm (mỗi giống 10 cá thể: 5 đực và 5 cái) đã được phân tích độ thuần bằng 10 chỉ thị RAPD. Độ thuần của giống tằm thể hiện thông qua tính đồng hình và số lượng của các phân đoạn ADN nhân bản. Kết quả nhận được cho thấy tỉ lệ phần trăm phân đoạn ADN đồng hình nằm trong phạm vi từ 68,83% (giống GQ11) đến 91,66% (giống GQ13). Tổng số phân đoạn ADN nhân bản được của 10 giống tằm là 333. Số phân đoạn ADN nhân bản của 10...

Chủ đề:

Bình luận(0) Đăng nhập để gửi bình luận!

Lưu

Nội dung Text: BÁO CÁO " ĐÁNH GIÁ ĐỘ THUẦN 10 GIỐNG TẰM (BOMBYX MORY L.) BẰNG CHỈ THỊ RAPD "

  1. Tạp chí Khoa học và Phát triển 2009: Tập 7, số 5: 620 - 627 TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG NGHIỆP HÀ NỘI §¸NH GI¸ §é THUÇN 10 GIèNG T»M (BOMBYX MORy L.) B»NG CHØ THÞ RAPD Assessment of the Genetic Homogeneity of 10 Silkworm Genotypes (Bombyx mory L.) by RAPD Markers Đinh Thị Phòng1, Nguyễn Thị Đảm2 1 Bảo tàng Thiên nhiên, Viện Khoa học và Công nghệ Việt Nam 2 Trung tâm Nghiên cứu dâu tằm tơ Địa chỉ email tác giả liên lạc: dinhthiphong@hotmail.com TÓM TẮT Trong nghiên cứu này, mười giống tằm (mỗi giống 10 cá thể: 5 đực và 5 cái) đã được phân tích độ thuần bằng 10 chỉ thị RAPD. Độ thuần của giống tằm thể hiện thông qua tính đồng hình và số lượng của các phân đoạn ADN nhân bản. Kết quả nhận được cho thấy tỉ lệ phần trăm phân đoạn ADN đồng hình nằm trong phạm vi từ 68,83% (giống GQ11) đến 91,66% (giống GQ13). Tổng số phân đoạn ADN nhân bản được của 10 giống tằm là 333. Số phân đoạn ADN nhân bản của 10 giống tằm khi phân tích với 10 chỉ thị RAPD dao động từ 20 (OPN05) đối với giống GQ14 đến 51 (OPP19) đối với giống GQ15. Số lượng các phân đoạn ADN nhân bản với mỗi mồi xê dịch từ 1 đến 11 phân đoạn. Kích thước phân đoạn DNA nhân bản nằm trong khoảng từ 200 bp đến 1800 bp. Trong số 10 giống tằm nguyên nghiên cứu, thì giống GQ11 có hệ số tương đồng di truyền đạt giá trị thấp nhất dao động từ 0,629 đến 1,000, giống GQ13 có hệ số tương đồng di truyền đạt cao nhất dao động từ 0,864 đến 1,000. Độ thuần của 10 giống tằm được sắp xếp thứ tự như sau: GQ13 > GQ14 > L2 > GQ23 > GQ16 > A18 > GQ17 > GQ15 > GQ12 > GQ11. Từ khoá: Chỉ thị RAPD, độ thuần, đồng hình ADN, giống tằm, hệ số tương đồng. SUMMARY In this study, 10 RAPD primers were used to investigate the genetic homogeneity at molecular level of 10 silkworm genotypes (each genotype consists of 5 males and 5 females). The homogeneity was assessed by the homomorphism and the number of amplified DNA fragments. The obtained results showed that the percentage of homomorphism of amplified DNA fragment ranges from 68.83% (GQ11) to 91.66% (GQ13). Ten RAPD primers generated total 333 bands. The numbers of DNA amplified fragments per 10 primer ranged from 20 (OPN05) in GQ14 genotype to 51 (OPP19) in GQ15 genotype.. The number of fragments ranged from 1 to 11 per primer, and from 200 bp to 1800 bp in length. Among studied silkworm genotypes, the least genetic similarity coefficient was found in GQ11 genotype with values varied from 0.629 to 1.000 and the highest coefficient was GQ13 genotype with the values varied from 0.864 to 1.000. The homogeneity level of ten silkworm genotypes was in the following order: GQ13 > GQ14 > L2 > GQ23 > GQ16 > A18 > GQ17 > GQ15 > GQ12 > GQ11. Key words: DNA homomorphism, Homogeneity, RAPD marker, similarity coefficient, silkworm genotype. 1. §ÆT VÊN §Ò cho ng−êi d©n. V× vËy, viÖc nghiªn cøu t¹o gièng t»m míi n¨ng suÊt, chÊt l−îng t¬ kÐn ë n−íc ta, trång d©u nu«i t»m lμ nghÒ cã kh¸ vμ thÝch nghi tèt víi ®iÒu kiÖn bÊt lîi tõ l©u ®êi. T¬ kÐn lμ mÆt hμng cã gi¸ trÞ xuÊt lu«n ®−îc ngμnh d©u t»m t¬ ViÖt Nam quan khÈu cao, mang l¹i lîi Ých kinh tÕ kh«ng nhá t©m nghiªn cøu. 620
  2. Đánh giá độ thuần 10 giống tằm (Bombyx mori L.) bằng chỉ thị RAPD Cho tíi nay, viÖc ®¸nh gi¸ ®é thuÇn cña cøu mèi quan hÖ di truyÒn còng nh− ®¸nh gièng chñ yÕu b»ng ph−¬ng ph¸p truyÒn gi¸ nhanh ®é thuÇn cña gièng (Kim vμ cs., thèng lμ dùa vμo mét sè ®Æc ®iÓm n«ng sinh 2006, Matsunaga vμ cs., 2002; Nagata vμ cs., häc nªn cã h¹n chÕ vÒ thêi gian vμ lÖ thuéc 1996; Quan vμ cs., 2002; Ng« Lª Th−¬ng vμ vμo m«i tr−êng. ViÖc chän gièng d−íi sù trî cs., 2005; NguyÔn ThÞ Thanh B×nh vμ cs., gióp cña kü thuËt ph©n tö ®ang trë thμnh 2004). §©y lμ nh÷ng nghiªn cøu rÊt cã gi¸ trÞ h−íng quan träng trong chän t¹o gièng vËt trong viÖc t¹o gièng t»m cã sù hç trî cña nu«i míi trong ®ã cã con t»m. ¦u ®iÓm cña c«ng nghÖ sinh häc hiÖn ®¹i ë ViÖt Nam. ph−¬ng ph¸p lμ kh«ng phô thuéc vμo ®iÒu C«ng tr×nh nghiªn cøu nμy ®Ò cËp ®Õn kiÖn m«i tr−êng mμ hiÖu qu¶ t¹o gièng cao. kÕt qu¶ “§¸nh gi¸ ®é thuÇn cña 10 gièng t»m C¸c chØ thÞ RFLP, AFLP, RAPD, SSR... ®−îc nguyªn (Bombyx mori) b»ng chØ thÞ RAPD’’ sö dông kh¸ phæ biÕn ®Ó ®¸nh gi¸ møc ®é ®a nh»m chän nhanh ra c¸c gièng t»m míi. d¹ng di truyÒn hoÆc x¸c ®Þnh vËt liÖu lai t¹o ®· ®−îc ¸p dông trªn nhiÒu ®èi t−îng sinh vËt ë nhiÒu phßng thÝ nghiÖm trong vμ ngoμi 2. NGUY£N LIÖU Vμ PH¦¥NG PH¸P n−íc (Powell vμ cs., 1996; Mace vμ cs., 2006; NGHI£N CøU §inh ThÞ Phßng vμ cs., 2009; NguyÔn ThÞ 2.1. Nguyªn liÖu Lang vμ cs., 2007). Kü thuËt RAPD (Random Amplified Polymorphic ADN) hay ®−îc sö Nhéng cña 10 gièng t»m GQ11, GQ12, dông v× t−¬ng ®èi ®¬n gi¶n, dÔ thùc hiÖn mμ GQ13, GQ14, GQ15, GQ16, GQ17, GQ23, L2 vÉn cho phÐp ph¸t hiÖn tÝnh ®a h×nh c¸c vμ A18 do Trung T©m nghiªn cøu d©u t»m t¬ ®o¹n ADN nh©n b¶n (Ferreira vμ Keim cung cÊp. C¸c mÉu nhéng ®−îc b¶o qu¶n ë (1997); Williams vμ cs., 1990). HiÖn nay, kü nhiÖt ®é -20oC cho tíi khi sö dông. Tªn gèc thuËt nμy còng ®· ®−îc øng dông ®Ó nghiªn cña c¸c gièng nh− ë b¶ng 1. B¶ng 1. KÝ hiÖu vμ tªn gèc cña 10 gièng t»m STT Kí hiệu Tên gốc STT Kí hiệu Tên gốc 1 GQ11 A1 6 GQ16 VN1 2 GQ12 810 7 GQ17 E38 3 GQ13 A2 8 GQ23 Đ2 4 GQ14 B42 9 L2 L2 5 GQ15 B46 10 A18 A18 2.2. Ph−¬ng ph¸p nghiªn cøu Ph¶n øng PCR - RAPD: T¸ch DNA tæng sè tõ c¸c gièng t»m: Mét ph¶n øng PCR cã thÓ tÝch 25 lÝt: bao ADN tæng sè ®−îc t¸ch tõ 10 c¸ thÓ (5 gåm dung dÞch ®Öm PCR 1X; 2,5 mM MgCl2; 2 ®ùc vμ 5 c¸i) cña mçi gièng t»m theo bé kÝt mM dNTPs; 200 nM ®o¹n måi; 0,5 ®¬n vÞ Taq #K0512 cña h·ng Fermentas, c¸c b−íc ®−îc polymerase vμ 10 ng DNA khu«n. Ph¶n øng thùc hiÖn theo protocol chØ dÉn cña nhμ s¶n PCR – RAPD thùc hiÖn trong m¸y PCR - xuÊt. KiÓm tra ®é s¹ch vμ hμm l−îng DNA Thermal Cycler 9700 theo chu tr×nh nhiÖt: b»ng ®o quang phæ hÊp thô kÕt hîp víi ®iÖn 940C trong 1 phót; 45 chu kú (920C trong 1 di trªn gel agarose 0,9%. phót; 350C trong 1 phót; 720C trong 1 phót); 621
  3. Đinh Thị Phòng, Nguyễn Thị Đảm 720C trong 10 phót; gi÷ s¶n phÈm ë 40C. §iÖn Trong nghiªn cøu nμy, 10 chØ thÞ RAPD di s¶n phÈm PCR trªn gel agarose 1,5%, ®· ®−îc sö dông ®Ó ph©n tÝch ®é thuÇn cña nhuém Ethidium bromide vμ chôp ¶nh trªn 10 gièng t»m (mçi gièng 10 c¸ thÓ: 5 con ®ùc m¸y soi gel cña h·ng Clever Scientific (Anh). vμ 5 con c¸i). KÕt qu¶ ph©n tÝch s¶n phÈm Ph©n tÝch sè liÖu: PCR - RAPD cho kÕt qu¶ lμ: sè ph©n ®o¹n Dùa trªn sù xuÊt hiÖn hay kh«ng xuÊt ADN nh©n b¶n ®−îc cña 10 gièng dao ®éng hiÖn cña c¸c ph©n ®o¹n DNA khi ®iÖn di s¶n tõ 20 (OPN05) ®Õn 51 (OPP19). KÝch th−íc phÈm PCR - RAPD víi c¸c ®o¹n måi ngÉu c¸c ph©n ®o¹n ADN nh©n b¶n n»m trong nhiªn cña 10 gièng t»m lμm c¬ së cho viÖc kho¶ng tõ 200 bp ®Õn 1800 bp. Trong ®ã, ph©n tÝch sè liÖu. TØ lÖ phÇn tr¨m tÝnh ®ång gièng GQ15 cã sè ph©n ®o¹n ADN nh©n b¶n h×nh c¸c ph©n ®o¹n ADN ®−îc tÝnh b»ng sè nhiÒu nhÊt (51 ph©n ®o¹n), Ýt nhÊt lμ gièng ph©n ®o¹n ADN ®ång h×nh trªn tæng sè ph©n GQ14 (20 ph©n ®o¹n). Tæng sè ®· thu ®−îc ®o¹n nh©n b¶n ®−îc. X¸c ®Þnh hÖ sè t−¬ng 333 ph©n ®o¹n ADN (B¶ng 2). ®ång di truyÒn, lËp biÓu ®å h×nh c©y ®Ó so §¸nh gi¸ ®é thuÇn cña gièng theo s¸nh hÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn gi÷a 10 c¸ ph−¬ng ph¸p truyÒn thèng lμ dùa vμo mét sè thÓ cña mçi gièng t»m theo ph−¬ng ph¸p Nei ®Æc ®iÓm h×nh th¸i nh− mμu s¾c da t»m, vμ Li (1979); Weir (1990). Sè liÖu ®−îc xö lý mμu t¬ kÐn, mμu trøng, thêi gian ph¸t dôc... b»ng ch−¬ng tr×nh NTSYSpc version 2.0 §é thuÇn cña gièng theo ph−¬ng ph¸p ph©n (Rohlf, 2001). tÝch ADN ®−îc x¸c ®Þnh b»ng tØ lÖ phÇn tr¨m c¸c ph©n ®o¹n ®ång h×nh trªn tæng sè c¸c ph©n ®o¹n ®−îc nh©n b¶n. KÕt qu¶ nhËn 3. KÕT QU¶ Vμ TH¶O LUËN ®−îc ë b¶ng 3 cho thÊy, trong c¸c gièng t»m 3.1. TÝnh ®ång h×nh c¸c ph©n ®o¹n ADN th× gièng GQ13 cã tØ lÖ c¸c ph©n ®o¹n ADN cña 10 gièng t»m víi c¸c chØ thÞ ®ång h×nh cao nhÊt (91,6%) vμ thÊp nhÊt lμ RAPD gièng GQ11 (68,8%). B¶ng 2. Sè ph©n ®o¹n ADN nh©n b¶n ®−îc cña 10 gièng t»m Số Mồi GQ11 GQ12 GQ13 GQ14 GQ15 GQ16 GQ17 GQ23 L2 A18 phân đoạn OPN05 3 2 2 1 3 1 1 3 2 2 20 OPB18 3 2 2 2 1 1 6 1 5 3 26 OPH03 5 7 2 4 7 3 7 7 2 5 49 OPP19 6 6 2 3 8 9 3 4 4 6 51 OPQ05 3 1 2 1 3 2 3 2 2 2 21 RA40 1 2 2 1 8 2 5 5 3 2 31 RA46 4 6 3 1 4 5 2 1 3 3 32 RA159 4 4 2 3 11 6 5 6 2 3 46 RA143 3 6 1 1 3 2 3 4 2 2 27 OPE14 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 30 Tổng 35 39 21 20 51 34 38 36 28 31 333 622
  4. Đánh giá độ thuần 10 giống tằm (Bombyx mori L.) bằng chỉ thị RAPD B¶ng 3. TÝnh ®ång h×nh ph©n ®o¹n ADN nh©n b¶n cña 10 gièng t»m ph©n tÝch víi 10 chØ thÞ RAPD (%) Mồi GQ11 GQ12 GQ13 GQ14 GQ15 GQ16 GQ17 GQ23 L2 A18 OPN05 66,7 100,0 100,0 100,0 66,7 100,0 100,0 66,7 100,0 100,0 OPP18 66,7 50,0 50,0 100,0 100,0 100,0 66,7 100,0 60,0 66,7 OPH03 80,0 71,4 100,0 75,0 57,1 66,7 71,4 57,1 100,0 60,0 OPP19 0,0 50,0 100,0 66,7 62,5 55,6 100,0 75,0 75,0 50,0 OPQ05 100,0 100,0 100,0 100,0 66,7 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 RA40 100,0 100,0 100,0 100,0 25,0 100,0 60,0 80,0 100,0 100,0 RA46 50,0 50,0 66,7 100,0 100,0 40,0 50,0 100,0 33,3 33,3 RA159 25,0 25,0 100,0 33,3 45,5 66,7 40,0 50,0 100,0 100,0 RA143 100,0 50,0 100,0 100,0 100,0 50,0 66,7 75,0 50,0 50,0 OPE14 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 Trung bình (%) 68,8 69,6 91,6 87,5 72,3 77,9 75,5 80,3 81,8 76,0 KÕt qu¶ ®iÖn di s¶n phÈm PCR-RAPD sè l−îng còng nh− kÝch th−íc c¸c ph©n ®o¹n cña 10 gièng t»m khi ph©n tÝch víi måi ADN nh©n b¶n ®uîc khi so s¸nh gi÷a c¸c c¸ OPE14 lμm ®¹i diÖn ®Ó minh häa cho kÕt thÓ cña mét gièng. C¸c ph©n ®o¹n ADN qu¶ ph©n tÝch tÝnh ®ång h×nh ph©n ®o¹n nh©n b¶n ®−îc ®Òu gièng nhau khi so s¸nh ADN. §é thuÇn cña mçi gièng t»m thÓ hiÖn ë gi÷a 10 c¸ thÓ cña mçi gièng t»m (H×nh 1). M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 1kb 0,5kb GQ11 GQ12 GQ13 GQ1 GQ15 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 1kb 0,5kb GQ16 GQ17 GQ23 L2 A18 H×nh 1. S¶n phÈm PCR-RAPD cña 10 gièng t»m víi chØ thÞ OPE14 trªn gel argarose 1,5% M: thang ph©n tö chuÈn 1 kb giÕng 1, 2, 3, 4 vμ 5: mÉu cña 5 con ®ùc giÕng 6, 7, 8, 9 vμ 10: mÉu cña 5 con c¸i 623
  5. Đinh Thị Phòng, Nguyễn Thị Đảm 3.2. HÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn cña 10 HÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn cña 10 c¸ gièng t»m thÓ gièng GQ11 (B¶ng 4) dao ®éng tõ 0,63 Ph−¬ng ph¸p nghiªn cøu dùa trªn lý ®Õn 1,00. ë kho¶ng tõ 0,60 ®Õn 0,70 cã 06 thuyÕt thèng kª to¸n häc vμ sinh häc. Ph©n cÆp chiÕm 13,3%, ë kho¶ng 0,71 ®Õn 0,80 cã nhãm theo hÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn b»ng 10 cÆp chiÕm 22,2%, ë kho¶ng 0,81 ®Õn 0,90 chØ thÞ ph©n tö kh«ng lÖ thuéc vμo yÕu tè cã 12 cÆp chiÕm 26,7 vμ ë kho¶ng tõ 0,91 ®Õn m«i tr−êng, v× thÕ cho phÐp c¸c nhμ chän 1,00 cã 17 cÆp chiÕm 37,7%. gièng nhanh chãng x¸c ®Þnh ®−îc ®é ®ång HÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn gi÷a 10 c¸ ®Òu cña gièng ë giai ®o¹n sím kh¸ hiÖu qu¶ thÓ cña gièng GQ13 (B¶ng 5) dao ®éng tõ mμ thêi gian t¹o gièng l¹i rót ng¾n. 0,80 ®Õn 1,00. Trong ®ã, duy nhÊt chØ cã 01 Dùa vμo kÕt qu¶ ph©n tÝch tÝnh ®ång cÆp (GQ13.6 vμ GQ13.3) cã hÖ sè t−¬ng ®ång h×nh ë b¶ng 3, hai gièng GQ11 (cã tÝnh ®ång di truyÒn thÊp nhÊt lμ 0,86 chiÕm 2,22%, vμ h×nh ph©n ®o¹n ADN nh©n b¶n thÊp nhÊt lμ ë kho¶ng tõ 0,91 ®Õn 1,00 cã 44 cÆp chiÕm 68,8%) vμ gièng GQ13 (cã tÝnh ®ång h×nh 97,78%. KÕt qu¶ nμy cho thÊy gièng GQ13 cã ph©n ®o¹n ADN nh©n b¶n cao nhÊt lμ 91,6%) ®é thuÇn gièng rÊt cao. ®−îc chän ®¹i diÖn ®Ó minh häa cho kÕt qu¶ KÕt qu¶ ph©n nhãm cña gièng GQ11 ph©n tÝch hÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn vμ mèi (H×nh 2A) vμ GQ13 (H×nh 2B) còng ph¶n quan hÖ di truyÒn th«ng qua biÓu ®å h×nh c©y. ¸nh kÕt qu¶ t−¬ng tù. B¶ng 4. HÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn cña 10 c¸ thÓ t»m gièng GQ11 theo hÖ sè di truyÒn cña Jaccard vμ kiÓu ph©n nhãm UPGMA GQ11.1 GQ11.2 GQ11.3 GQ11.4 GQ11.5 GQ11.6 GQ11.7 GQ11.8 GQ11.9 GQ11.10 GQ11.1 1,00 GQ11.2 0,91 1,00 GQ11.3 0,91 0,94 1,00 GQ11.4 0,94 0,85 0,85 1,00 GQ11.5 0,79 0,82 0,77 0,74 1,00 GQ11.6 0,88 0,79 0,84 0,93 0,68 1,00 GQ11.7 0,91 0,82 0,82 0,97 0,71 0,97 1,00 GQ11.8 0,71 0,79 0,74 0,66 0,90, 0,63 0,63 1,00 GQ11.9 0,91 0,82 0,82 0,97 0,71 0,97 1,00 0,63 1,00 GQ11.10 0,91 0,82 0,82 0,97 0,71 0,97 1,00 0,63 1,00 1,00 B¶ng 5. HÖ sè t−¬ng ®ång di truyÒn cña 10 c¸ thÓ t»m gièng GQ13 theo hÖ sè di truyÒn cña Jaccard vμ kiÓu ph©n nhãm UPGMA GQ13.1 GQ13.2 GQ13.3 GQ13.4 GQ13.5 GQ13.6 GQ13.7 GQ13.8 GQ13.9 GQ13.10 GQ13.1 1,00 GQ13.2 0,95 1,00 GQ13.3 0,91 0,95 1,00 GQ13.4 0,95 1,00 0,95 1,00 GQ13.5 0,95 1,00 0,95 1,00 1,00 GQ13.6 0,96 0,91 0,86 0,91 0,91 1,00 GQ13.7 0,91 0,95 0,91 0,95 0,95 0,96 1,00 GQ13.8 0,91 0,95 0,91 0,95 0,95 0,96 1,00 1,00 GQ13.9 0,95 1,00 0,95 1,00 1,00 0,91 0,95 0,95 1,00 GQ13.10 0,95 1,00 0,95 1,00 1,00 0,91 0,95 0,95 1,00 1,00 624
  6. Đánh giá độ thuần 10 giống tằm (Bombyx mori L.) bằng chỉ thị RAPD GQ13.1 GQ11.1 GQ13.6 GQ11.2 GQ13.2 GQ11.3 GQ13.4 GQ11.4 GQ13.5 GQ11.7 GQ13.9 GQ11.9 GQ11.10 GQ13.10 GQ11.6 GQ13.7 GQ11.5 GQ13.8 GQ11.8 GQ13.3 0.90 0.93 0.95 0.97 1.00 0.70 0.77 0.85 0.93 1.00 He so tuong quan He so tuong quan A B H×nh 2. BiÓu ®å h×nh c©y cña 10 c¸ thÓ t»m gièng GQ11(A) vμ gièng GQ13 (B) theo hÖ sè di truyÒn cña Jaccard vμ kiÓu ph©n nhãm UPGMA §èi víi 10 c¸ thÓ gièng GQ11 cã hÖ sè b»ng chøng cã gi¸ trÞ cña c«ng nghÖ sinh häc t−¬ng ®ång di truyÒn dao ®éng trong kho¶ng hiÖn ®¹i hç trî cho c«ng t¸c chän t¹o c¸c tõ 0,70 ®Õn 1,00. Trong ®ã ba c¸ thÓ GQ11.7, gièng t»m míi. GQ11.9 vμ GQ11.10 gièng nhau hoμn toμn Appukuttan vμ cs. (2005) ®· sö dông 20 vÒ mÆt di truyÒn cã hÖ sè b»ng 1,00 (H×nh chØ thÞ RAPD vμ ISSR ®Ó ®¸nh gi¸ møc ®é 2A), nh−ng kh¸c víi c¸c c¸c thÓ cßn l¹i thay ®æi ph©n tö cña hai nhãm t»m (nhãm cã kho¶ng 3% (1 - 0,70). thêi gian ph¸t dôc ng¾n vμ nhãm cã thêi §èi víi gièng GQ13 cã hÖ sè t−¬ng di gian ph¸t dôc dμi) cña bèn thÕ hÖ t»m truyÒn dao ®éng tõ 0,93 ®Õn 1,00. Trong ®ã Nistari tù phèi. KÕt qu¶ nhËn ®−îc cho thÊy n¨m c¸ thÓ GQ13.2, GQ13.4, GQ13.5, nhãm t»m cã thêi gian ph¸t dôc ng¾n thuÇn GQ13.9 vμ GQ13.10 hîp thμnh 1 nhãm vμ cã h¬n c¸c nhãm t»m cã thêi gian ph¸t dôc dμi. hÖ sè di truyÒn b»ng 1,00 (gièng nhau hoμn ë ViÖt Nam, TrÞnh §×nh §¹t vμ cs. (2003) toμn). T−¬ng tù, hai c¸ thÓ GQ13.7 vμ còng sö dông hÖ isozym esteraza ®Ó ®¸nh GQ13.8 còng lËp thμnh 1 nhãm vμ cã hÖ sè gi¸ ®é thuÇn cña 4 gièng t»m vμ ®· chØ ra di truyÒn b»ng 1,00. Tuy nhiªn gi÷a hai gièng §KS cã ®é thuÇn gièng cao thÓ hiÖn ë nhãm cã kho¶ng c¸ch di truyÒn kho¶ng tÇn sè alen xuÊt hiÖn ë c¸c locut Est 02, Est- 0,05% (1 - 0,95) (H×nh 2B). 3, Est -4, Est – 5 vμ Est – 6. §Æng §×nh §μm Dùa vμo c¸c kÕt qu¶ nhËn ®−îc trªn ®©y, vμ cs. (2008) còng ®· sö dông 05 måi RAP ®é thuÇn cña 10 gièng t»m míi chän t¹o vμ 05 cÆp måi SSR ®Ó ®¸nh gi¸ ®é thuÇn cña ®−îc x¸c ®Þnh xÕp theo thø tù tõ cao ®Õn 10 gièng t»m nguyªn vμ cho thÊy gièng Q16 thÊp nh− sau: cã ®é thuÇn ®¹t cao nhÊt (sè ph©n ®o¹n ADN GQ13 > GQ14 > L2 > GQ23 > GQ16 ®ång h×nh chiÕm 89,72%). >A18 > GQ17 > GQ15 > GQ12 > GQ11. KÕt qu¶ ph©n tÝch ë møc ®é ph©n tö cña 4. KÕT LUËN 10 gièng t»m nguyªn trªn ®©y còng hoμn toμn phï hîp víi kÕt qu¶ ®¸nh gi¸ ®é thuÇn TÊt c¶ 10 chØ thÞ RAPD dïng ®Ó ph©n th«ng qua mét sè chØ tiªu h×nh th¸i do Trung tÝch ®é thuÇn cho 10 gièng t»m ®Òu chØ ra t©m Nghiªn cøu d©u t»m t¬ nghiªn cøu (sè tÝnh ®ång h×nh c¸c ph©n ®o¹n ADN nh©n liÖu kh«ng chØ ra ë ®©y). §©y còng lμ nh÷ng b¶n ®−îc, trong ®ã chØ thÞ OPE14 chØ ra tÝnh 625
  7. Đinh Thị Phòng, Nguyễn Thị Đảm ®ång h×nh cao nhÊt (100% ph©n ®o¹n ADN truyÒn 19 mÉu giæi xanh b»ng chØ thÞ nh©n b¶n ®Òu gièng nhau vÒ kÝch th−íc còng RAPD vμ DNA lôc l¹p. T¹p chÝ C«ng nghÖ sè l−îng khi so s¸nh gi÷a c¸c c¸ thÓ cña mét sinh häc 7 (1): 73-81. gièng). Ferreira AR., P. Keim (1997). Genetic Tæng sè cã 333 ph©n ®o¹n ADN ®−îc Mapping of Soybean [Glycine max (L.) nh©n b¶n, gièng GQ15 cã sè ph©n ®o¹n ADN Merr.]. Using Random Amplified nh©n b¶n ®−îc nhiÒu nhÊt (51 ph©n ®o¹n) vμ Polymorphic ADN (RAPD). Plant Mol Biol gièng GQ14 cã sè ph©n ®o¹n ADN nh©n b¶n Rep 15(4), pp. 335- 354. ®−îc Ýt nhÊt (20 ph©n ®o¹n). HÖ sè t−¬ng Kim MK., MJ. Park, WH. Jeong, KC. Nam, ®ång di truyÒn gi÷a 10 c¸ thÓ gièng GQ11 J. Chung (2006). SSR marker tightly ®¹t gi¸ trÞ thÊp nhÊt (dao ®éng tõ 0,63 ®Õn linked to the Ti locus in Soybean [Glycine 1,00) vμ cao nhÊt lμ gièng GQ13 (dao ®éng tõ max (L.) Merr.]. Euphytica 152(3): 361- 0,86 ®Õn 1,00). 366. §é thuÇn cña 10 gièng t»m ®−îc s¾p xÕp Mace ES., DT. Phong, HD. Upadhyaya, ES. thø tù nh− sau: GQ13 > GQ14 > L2 > GQ23 Chandra, JH. Crouch (2006). SSR > GQ16 > A18 > GQ17 > GQ15 > GQ12 analysis of cultivated groundnut (Arachis > GQ11. hypogaea L.) germplasm resistant to rust and late leaf spot diseases. Euphytica 152, Lêi c¶m ¬n pp. 317-33. C«ng tr×nh ®−îc hoμn thμnh nhê kinh Matsunaga TM., H. Fujiwara (2001). phÝ cña ®Ò tμi “Nghiªn cøu mét sè gi¶i ph¸p Identification and charaterization of genes khoa häc c«ng nghÖ nh»m ph¸t triÓn s¶n abnormally expressed in wing-deficient xuÊt d©u t»m bÒn v÷ng phôc vô néi tiªu vμ mutant (Flugellos) of the silkworm, xuÊt khÈu” m· sè KC.06.13/06-10 do Trung bombyx mori. Insect Biochem Mol. Boil. t©m Nghiªn cøu d©u t»m t¬ chñ tr×. C¸c t¸c 32, pp. 691- 699. gi¶ xin ch©n thμnh c¶m ¬n sù hç trî sö dông Nagata TY., KU. Suzuki, H. Kokubo, X. Xu mét sè trang thiÕt bÞ cña Phßng C«ng nghÖ (1996). Develpomental expression of the TÕ bμo thùc vËt, ViÖn C«ng nghÖ Sinh häc. bombyx antennapedia homologue and homeotic changes in the Nc mutant. Genes Cells 1, pp. 555-568. TμI LIÖU THAM KH¶O Nei M., WH. Li (1979). Mathematical model Appukaran RP, NC. Shankar, VN. for studying genetic variation in terms of Chirakkara (2005). Genetic differentiation restriction and nucleases. Proc. Natl. Sci., induced by selection in an inbred 76, pp. 5269-5273. population of the silkworm Bombyx mori, Ng« Lª Th−¬ng, TrÞnh H÷u H»ng, NguyÔn revealed by RAPD and SSR maker ThÞ Thanh B×nh (2005). Nghiªn cøu ®a systems. Appl genet 46 (3), pp. 291-298. h×nh ph©n tö vμ nhËn biÕt mét sè gièng §Æng §×nh §μm, Ph¹m ThÞ Th¬, Ph¹m V¨n t»m l−ìng hÖ ViÖt Nam b»ng kü thuËt D−¬ng, NguyÔn ThÞ Thanh B×nh (2008). PCR-RAPD. B¸o c¸o Héi nghÞ khoa häc Nghiªn cøu ®¸nh gi¸ ®é thuÇn cña c¸c toμn quèc nh÷ng vÊn ®Ò nghiªn cøu c¬ b¶n gièng t»m nguyªn vμ mét sè tæ hîp lai trong khoa häc sù sèng th¸ng 11/2005, Tr. ®ang chän t¹o. B¸o c¸o tæng kÕt ®Ò tμi cÊp 1424 -1427. Bé n¨m 2008. NguyÔn ThÞ Lang, NguyÔn §øc ThuËn, Bïi §inh ThÞ Phßng, §ç TiÕn Ph¸t, NguyÔn V¨n ChÝ Böu (2007). Nghiªn cøu sù ®a d¹ng di Ph−îng, PhÝ Hång H¶i (2009). §a d¹ng di truyÒn cña mét sè gièng ®Ëu nμnh b»ng 626
  8. Đánh giá độ thuần 10 giống tằm (Bombyx mori L.) bằng chỉ thị RAPD chØ thÞ RAPD vμ SSR. T¹p chÝ C«ng nghÖ Rohlf FJ. (2001). NTSYS Numerical Sinh häc 5(2), Tr. 233-245. Taxonomy and Multivariate Analysis NguyÔn ThÞ Thanh B×nh, Hoμng ThÞ H»ng, System, Version 2.0, Exeter Software N«ng V¨n H¶i (2004). Nghiªn cøu ®a h×nh Publ., Setauket, New York. mét sè gièng t»m d©u b»ng kü thuËt TrÞnh §×nh §¹t, Ng« ThÞ Hoan, NguyÔn V¨n RAPD. T¹p chÝ Di truyÒn häc vμ øng dông Qu¶ng, NguyÔn V¨n s¸ng, Dinh Nho Th¸i 1, Tr. 19 - 24. (2003). Sù ®a h×nh di truyÒn hÖ Isozym Powell W., M. Morgante, C. Andre, M. esteraza ë mét sè loμi mèi vμ t»m d©u. Hanafey, J. Vogel, S. Tingey, A. Rafalski T¹p chÝ Di truyÒn vμ øng dông 2, Tr. 18 - (1996). The comparison of RFLP, RAPD, 22. AFLP and SSR markers for germplasm Weir BS (1990). Genetic data analysis - analysis. Molecular Breeding 2(3), pp. 225 - 238. Methods for discrete genetic data, Sinauer Quan GX., I. Kim, N. Komono, H. Sezutsu, Associates, Inc., Sunderland. M. Ote (2002). Characterization of the Williams JGK, AR. Kubelik, KJ Livak, JA kynurenine 3-monooxygenase gene Rafalski, SV. Tingey (1990). DNA corresponding to the white egg 1 mutant polymorphisms amplified by arbitrary in the silkworm Bombyx mori. Mol. Genet. primers are useful as genetic markers. Genomics 267, pp. 1-9. Nucleic Acids Res 18, pp. 6531 - 6535. 627
ADSENSE

CÓ THỂ BẠN MUỐN DOWNLOAD

LV.01: Bộ Luận Văn Thạc Sĩ Quản Trị Kinh Doanh MBA
165 tài liệu
2062 lượt tải
THÔNG TIN
TRỢ GIÚP
HỖ TRỢ KHÁCH HÀNG
Theo dõi chúng tôi

Chịu trách nhiệm nội dung:

Nguyễn Công Hà - Giám đốc Công ty TNHH TÀI LIỆU TRỰC TUYẾN VI NA

LIÊN HỆ

Địa chỉ: P402, 54A Nơ Trang Long, Phường 14, Q.Bình Thạnh, TP.HCM

Hotline: 093 303 0098

Email: support@tailieu.vn

Giấy phép Mạng Xã Hội số: 670/GP-BTTTT cấp ngày 30/11/2015 Copyright © 2022-2032 TaiLieu.VN. All rights reserved.

 

Đồng bộ tài khoản
2=>2