Dữ liệu genbank
-
Nghiên cứu này góp phần hoàn thiện vùng trình tự ITS cũng như lần đầu công bố thêm vùng trình tự matK và trnL-F cho loài C. xanthella. Ngoài ra, nghiên cứu này cũng lần đầu công bố vùng trình tự ITS2, matK và trnL-F cho loài C. cotuana.
9p vimarillynhewson 02-01-2024 5 2 Download
-
Mục tiêu của bài viết "Xác định locus kiểu giao phối ở nấm Cordyceps militaris bằng kỹ thuật Multiplex PCR" là thiết kế các đoạn mồi đặc hiệu cho phản ứng Multiplex PCR được xác định dựa vào trình tự của hai locus kiểu giao phối MAT1-1 (AB194982) và MAT1-2 (AB084257) trên cơ sở dữ liệu của GenBank bằng công cụ Primer-BLAST.
10p kimphuong1137 27-10-2023 8 3 Download
-
Phân tích phả hệ 2 chủng CDVHN6 và CDVHN7 thu nhận tại Hà Nội năm 2019 cho thấy sự gần gũi với chủng CDV/dog/HCM/33/140816 của Việt Nam (số GenBank: LC159587) thuộc genotye Asia-1 cùng với các chủng của châu Á bao gồm Trung Quốc, Thái Lan, Đài Loan. Tuy nhiên, hiện nay mới chỉ có được một hệ gen duy nhất CDV Thành phố Hồ Chí Minh 2014 đã công bố trên Ngân hàng gen, do vậy việc bổ sung thêm thông tin về nguồn dữ liệu gen của virus care là rất cần thiết nhằm góp phần nghiên cứu và sản xuất vaccine tái tổ hợp phòng bệnh cho chó tại Việt Nam.
9p mudbound 10-12-2021 24 2 Download
-
rong nghiên cứu này, trình tự ORF mã số [denovogenes] 32768 mã hóa cho β-glucosidase được khai thác từ dữ liệu DNA metagenome suối nước nóng Bình Châu được lựa chọn để biểu hiện trong vector pET17b do có độ tương đồng amino acid thấp với các enzyme trong GenBank, có chỉ số kiềm tính và Tm cao.
7p princessmononoke 28-11-2021 17 2 Download
-
Nghiên cứu “Đánh giá khả năng phân loại của hai chỉ thị rbcL và trnL với một số mẫu Bách bộ (Stemonaceae) thu tại phía Bắc Việt Nam” để đánh giá mối quan hệ di truyền giữa Bách bộ với những loài cùng chi đã được định danh trên GenBank, qua đó góp phần bổ sung cơ sở dữ liệu về phân tử, đồng thời làm cơ sở cho việc phân tích di truyền và ứng dụng vào thực tiễn, như nhận diện và bảo tồn sự phát triển các loài Bách bộ của Việt Nam.
5p despicableme36 12-09-2021 25 2 Download
-
Bằng việc so sánh trình tự trnL intron và trnL-trnF IGS giữa 2 loài nghiên cứu với các loài hiện có trên GenBank, đặc biệt là loài H. aromatica, một loài có đặc điểm hình thái tương tự với loài H. occulta. Bài viết này đã xác định H. occulta và H. aromatica là 2 loài riêng biệt. Kết quả nghiên cứu đã cung cấp dữ liệu khoa học để khẳng định chính xác vị trí phân loại của một số loài thuộc chi Homalomena. Mời các bạn cùng tham khảo!
11p tunelove 12-06-2021 11 2 Download
-
Trong 27 mẫu phân lập vi khuẩn Bacillus thuringiensis từ một số tỉnh thành phía nam Việt Nam sinh tinh thể hình thoi có 21 mẫu dương tính với nhóm gen cry2A bằng kỹ thuật PCR. Kết quả phân tích trình tự DNA cho thấy các sản phẩm khuếch đại thuộc nhóm gen cry2A của vi khuẩn B. thuringiensis và có độ tương đồng trên 90% với các trình tự gen cry2A được công bố trên cơ sở dữ liệu gen GenBank. Sản phẩm khuếch đại của mẫu BT5 và TN7.1 với cặp primer chung cho nhóm gen cry2A có độ tương đồng lần lượt là 97 và 99%. Sản phẩm PCR của mẫu TN7.
8p angicungduoc2 02-01-2020 55 3 Download
-
Nghiên cứu này trình bày kết quả phân lập một số chủng vi khuẩn có khả năng phân hủy dibenzofuran, một dẫn xuất của dioxin, từ đất nhiễm dioxin ở A Lưới, Thừa Thiên Huế. Các mẫu đất được thu nhận từ 5 địa điểm khác nhau trên nền sân bay Aso cũ. Từ các mẫu đất đã thu được 3 chủng vi sinh vật sinh trưởng và phát triển mạnh trên môi trường tối thiểu bổ sung dibenzofuran làm nguồn carbon. Phân tích trình tự 16S rDNA của các chủng phân lập được cho thấy chúng tương đồng cao với Enterobacter cloacae (99%), Staphylococcus sp. (99%) và Achromobacter sp. (100%).
8p nhadamne 31-12-2019 75 2 Download
-
Mục tiêu của đề tài là nghiên cứu định danh 2 chủng vi nấm bằng phương pháp hình thái và giải trình tự gen đoạn ITS rDNA, đồng thời xác định khả năng phân giải các cơ chất collagen, gelatin, cellulo của chúng. Các phương pháp thực hiện bao gồm: Nghiên cứu thực nghiệm, mô tả, so sánh các dữ liệu thu thập được với dữ liệu khóa phân loại và dữ liệu genbank. Nghiên cứu được tiến hành trên 2 chủng vi nấm phân lập được ở Viện 69.
6p hanh_tv25 31-03-2019 52 2 Download
-
Bài viết cung cấp dẫn liệu phân tử của 10 loài chân kép họ Paradoxosomatidae ở Việt Nam. Một đoạn trình tự 680 bp của gen ty thể COI (Cytochrome c Oxidae Subunit I) đã được giải mã và lưu trữ trên ngân hàng gen (GenBank). Tập hợp dữ liệu sau khi sắp xếp và căn chỉnh của đoạn gen COI có kích thước 571 bp từ 14 mẫu thuộc 11 loài; trong đó loài ngoài nhóm được sử dụng là Polydesmus denticulatus (C.L. Koch, 1847), thuộc họ Polydesmidae.
8p jangni 16-04-2018 55 0 Download
-
Giới thiệu Mô hình dữ liệu NCBI (tuần 1) Cơ sở dữ liệu trình tự GenBank (tuần 2) Cơ sở dữ liệu về cấu trúc (tuần 3) Cơ sở dữ liệu bản đồ genom (tuần 4) - Các cơ sở dữ liệu Cơ sở dữ liệu NCBI (National Center for Biotechnology Information) Cơ sở dữ liệu EMBL-EBI (European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute) Cơ sở dữ liệu CIB-DDBJ (Center for Information Biology-DNA Data Bank of Japan)
6p trautuongquan 25-02-2013 220 44 Download
-
- Bảng chú thích các trƣờng và một số nguyên tắc tìm kiếm Trƣờng (Fields) Locus Chú thích (Comments) Trƣờng Locus chứa 1 số những yếu tố dữ liệu khác nhau, bao gồm tên Locus, chiều dài trình tự, loại phân tử, khu vực GenBank (division) và ngày cập nhật. Locus name Locus name trong ví dụ trên là SCU49845. Locus name là một cách trình bày đặc biệt để giúp nhóm những mục từ (entries) có trình tự tƣơng đồng: ba ký tự đầu tiên thƣờng để chỉ sinh vật; bốn và năm chữ tiếp theo thƣờng dùng để...
22p zues03 19-06-2011 85 9 Download
-
Phân tích phát sinh chủng loài đối với nhóm Aplhavirus đã được thực hiện từ lâu trước đây bằng cách sử dụng một đoạn gene nào đó, hoặc cả một gene hoặc một phần dữ liệu proteomics. Trên tờ Comaparative and Functional Genomics 6 ,nhóm tác giả Luers và cộng sự đã sử dụng trình tự cDNA và protein từ ngân hàng dữ liệu GenBank để phân tích quá trình tiến hóa của nhóm virus này.
5p heoxinhkute4 27-09-2010 79 6 Download