Số gen trong genome

Các nghiên cứu tương quan toàn bộ hệ gen (GWAS: Genome-wide association study) là một công cụ rất hiệu quả để nghiên cứu vai trò của yếu tố di truyền trong các bệnh lý đa nguyên nhân phức tạp. Tuy nhiên, với số lượng các điểm đa hình đơn nucleotide rất lớn được sử dụng trong các chip microarray, việc kiểm soát chất lượng dữ liệu từ các mẫu nghiên cứu là hết sức cần thiết. Thông qua nghiên cứu này, tác giả đã sử dụng các kỹ thuật sinh tin học để kiểm soát chất lượng các mẫu được phân tích toàn bộ hệ gen trên 494 người bình thường và 503 bệnh nhân đái tháo đường típ 2.

7p kimphuong1129 25-09-2023 6 2   Download

Nghiên cứu liên kết trên toàn hệ gen (genome-wide association study - GWAS) là một công cụ hiện đại để xây dựng bản đồ di truyền liên kết các tính trạng số lượng (QTL) ở cây trồng. Trong nghiên cứu này, các tác giả đưa ra kết quả GWAS tính trạng khả năng đường hóa của cây lúa dựa trên cơ sở dữ liệu giải trình tự kiểu gen (GBS) và khả năng chuyển hóa đường từ rơm rạ của 170 mẫu giống lúa thuộc nhóm Indica được thu thập ở Việt Nam.

6p kethamoi10 29-01-2021 28 2   Download

Bài nghiên cứu này áp dụng phương pháp phân tích tổng quan dựa trên hệ gen học (genome-wide characterization) cho họ gen Rboh trên hệ gen của cây đậu tương [(Glycine max L. Merr.)]. Sử dụng trình tự hệ gen chất lượng cao, chúng tôi đã xác định được 17 gen Rboh ở cây đậu tương. Các gen Rboh này phân bố khá đồng đều trải dài trên 14 trong tổng số 20 nhiễm sắc thể của cây đậu tương.

11p viathena2711 08-10-2019 43 1   Download

Trong nghiên cứu, 30 chỉ thị ISSR đã được sử dụng để nghiên cứu đa dạng di truyền genome của 35 mẫu Sơn tra thu thập ở 7 quần thể (Mường La, Cà Mạ, Bắc Yên, Trạm Tấu, Mù Căng Chải, Bát Xát and Sìn Hồ). Kết quả chỉ ra 28/30 chỉ thị chỉ ra tính đa hình và nhân bản được 148 phân đoạn DNA, trong đó có 96 phân đoạn đa hình (chiếm 64,86%). Trung bình giá trị đa dạng gen trên một locus (Hj) và hàm lượng thông tin đa hình của các chỉ thị tương ứng là 0,133 và 0,119.

12p hanh_tv31 26-04-2019 41 1   Download

Nhóm nghiên cứu đã sử dụng phương pháp GWAS (Genome-wide association study) đối với các tính trạng phát sinh bộ rễ lúa trong tập đoàn 182 giống lúa bản địa Việt Nam. Với tổng số 50 000 chỉ thị GBS đã được sử dụng, thu được tổng số 25 971 marker cho chỉ số đa hình (PIC) biến động từ 1% đến 50%. Kết quả thống kê di truyền liên kết đối với các tính trạng phát sinh bộ rễ, xác định được 66 markers cho toàn bộ tập đoàn nghiên cứu có sự sai khác ý nghĩa ở mức P-value ≤ 1E-04, tương đương với số QTLs đã được xác định.

7p hanh_tv29 20-04-2019 39 1   Download

Đề tài nghiên cứu về nhân giống và kỹ thuật lúa lai thâm canh, ba dòng cho các tỉnh miền Bắc Việt Nam và đồng bằng sông Cửu Long. Nghiên cứu và phát triển lúa lai ở Việt Nam trong 20 năm gần đây không phải là bất ngờ, nhưng cũng đạt được kết quả đáng khích lệ. Bên cạnh những kết quả đạt được, các nghiên cứu và phát triển này đã phải đối mặt với một số điều kiện hạn chế, bao gồm lực lượng nghiên cứu, chính sách, điều kiện thời tiết, thiên tai và sâu bệnh, nguồn gen của cha mẹ và genome kháng lúa.

10p hanh_tv28 19-04-2019 42 1   Download

Khoảng cách di truyền giữa mtDNA chó Phú Quốc nòi E1, E4 và và chó Pusang (EU789662) nằm chung trong 1 cụm trên cây tiến hóa lần lượt là 0,072% và 0,24% cho thấy chó Phú Quốc mang haplotype E có quan hệ rất gần với các chó Pungsan ở Triều Tiên. Mặc dù cùng haplogroup nhưng khoảng cách di truyền của chó Phú Quốc dòng E1 và E4 lại ở mức 0,23%. Trong khi đó khoảng cách di truyền giữa chó Phú Quốc dòng E1, E4 so với các chó sói xám nằm ở vị trí phân kỳ chị em trên phả hệ đồ lần lượt là 0,3, và 0,1%. Genome ty thể chó mang dòng E4 là lần đầu tiên được giải mã và phân tích trên thế giới.

10p nguyenhong1235 28-11-2018 47 4   Download

Trong nghiên cứu này, chúng tôi nghiên cứu một số yếu tố ảnh hưởng đến phản ứng PCR (Polymerase Chain Reaction) nhằm phát hiện nhanh Salmonella spp. so với các kỹ thuật sinh hóa truyền thống. Bộ genome của Salmonell spp. được thu nhận từ phương pháp dung dịch tách chiết (I, II, III, IV). Trình tự gen độc tố (enterotoxin) được khuếch đại bằng kỹ thuật PCR với các cặp mồi đặc hiệu khác nhau như UNI_O, UNI_I, InvA_fr, InvA_12.

8p quaymax4 05-09-2018 115 4   Download

Trong nghiên cứu này, bài viết phân tích đặc điểm kích thước của một số đoạn SSR và đánh giá sự đa dạng genome các giống/dòng chè thu thập tại xã Tân Cương, thành phố Thái Nguyên, tỉnh Thải Nguyên; Công ty chè Sông Cầu và xã Trại Cài – huyện Đồng Hỷ tỉnh Thái Nguyên. DNA tổng số từ các mẫu nghiên cứu được sử dụng làm khuôn để thực hiện kỹ thuật PCRSSR với 5 cặp mồi đặc hiệu.

10p blackwidow123 15-06-2018 82 2   Download

Bài viết áp dụng kỹ thuật giải trình tự Ion Torrent nhằm xây dựng cơ sở dữ liệu EST từ mô thận của cá tra nuôi ở độ mặn 9 ppt. Kết quả giải trình tự đạt được 2.623.929 đoạn trình tự có chiều dài trung bình là 104 bp sau khi sàng lọc loại bỏ các đoạn trình tự có chất lượng thấp. Các đoạn trình tự được lắp ráp thành contig sử dụng các phần mềm lắp ráp CLC Genomic Workbench, Trinity và Velvet/Oases, trong đó CLC là chương trình lắp ráp tối ưu nhất.

8p jangni 16-04-2018 53 0   Download

Trong bài viết này, chúng tôi đã tìm được 121 protein giàu Met (AtMRP) từ cơ sở dữ liệu genome của cây Arabidopsis thaliana, trong đó, khoảng 50% số gen là chưa được xác định chức năng. Dựa trên các nghiên cứu trước đây về biểu hiện của gen trong điều kiện bất lợi, chúng tôi đã xác định được 23 và 16 gen AtMRP có mức độ phiên mã tăng và giảm tương ứng trong điều kiện hạn, 11 và 17 gen có mức biểu hiện tăng và giảm khi xử lý mặn.

9p jangni 16-04-2018 75 3   Download

Phần mềm BioNumerics hiện được công nhận là phần mềm tin sinh học hiện đại với nhiều tính năng nổi bật. BioNumerics lần đầu tiên được áp dụng trong phân tích đặc điểm di truyền của chủng virus Rubella phân lập từ các dịch tại miền Nam Việt Nam trong năm 2007. Cây phát sinh loài của virus Rubella được dựng bởi phàn mềm BioNumerics dựa trên chuỗi ADN genom E1. So sánh với các genotyp chủng Rubella lưu hành tại các nước khác cho thấy chủng Rubella hoang dã đã lưu hành tại Việt Nam được xác địnhthuộc nhóm RGII - 2B.

7p uocvong02 24-09-2015 99 6   Download

Bài thuyết trình: Từ gen đến sinh vật chuyển gen trình bày thành phần của genome, cấu trúc của gen, số gen trong genome, mô tả genome hệ thống, chọn lọc bằng phương pháp truyền thống, đột biến thực nghiệm trong genome.

42p thuyancn 25-06-2015 74 12   Download

Giới thiệu về ADN satellite. Ở Eukaryote nói chung, và ở loài người nói riêng, trong genomes thì chỉ có chừng 5% là các trình tự mã hóa cho protein hoặc ARN (được gọi là gen). Số còn lại là các trình tự không mã hóa, trong số này trình tự ADN lặp lại liên tiếp chiếm một vị trí quan trọng, chúng được gọi là Tandem Repeat Sequence.

11p meomay_12 26-12-2013 118 10   Download

Lập bản đồ di truyền (genetic mapping) Việc lập bản đồ gene là một bước quan trọng trong việc tìm hiểu, chẩn đoán và điều trị các bệnh di truyền. Hiện nay đã có trên 14.000 gene trong số khoảng từ 30.000 đến 40.000 gene trong genome của người đã được xác định vị trí trên nhiễm sắc thể và chỉ khoảng 1.500 bệnh do đột biến gene đã xác định được đột biến trên các gene đặc hiệu. Như vậy rõ ràng là vẫn còn rất nhiều việc phải làm để tìm hiểu các biến đổi xảy ra trên gene...

9p butmauvang 29-08-2013 263 14   Download

Di truyền ty thể Đa số các bệnh di truyền gây ra do các khuyết tật xảy ra trên genome trong nhân tế bào, tuy nhiên cũng có một số bệnh di truyền chiếm tỷ lệ không lớn gây ra do các đột biến của ADN ty thể (mtADN, mt: mitochondria). Mỗi tế bào người chứa hàng trăm ty thể trong bào tương. Quá trình sao mã của mtADN xảy ra ở trong ty thể và độc lập với nhân. Khác với ADN của nhân, mtADN không có các đoạn intron. Tỷ lệ đột biến ở ADN trong ty thể .cao hơn...

5p butmauvang 29-08-2013 185 31   Download

Chuyển nạp gen (gene transformation) là kỹ thuật chuyển gen ngoại lai vào genome cây trồng. Công nghệ gen thực vật diễn biến nỗi bật qua các móc thời gian tạo ra những bước tiến ngày càng xa và khả năng ứng dụng cũng tăng theo

0p phamhau_ttbb 15-11-2011 344 54   Download

Allene oxide synthase (AOS) là một enzyme quan trọng trong số các enzyme tham gia vào quá trình tổng hợp axit jasmonic thông qua con đường sinh hoá octadecanoid. Ở thực vật, axit jasmonic đóng vai trò then chốt trong việc hình thành các phản ứng đáp lại các tác động của môi trường trong và ngoài tế bào. Để làm tăng hàm lượng enzyme allene oxide synthase nội sinh ở lúa, gen allene oxide synthase 2 của Arabidopsis...

8p thulanh2 07-09-2011 56 7   Download

blund end: đầu bằng. Đầu tận cùng của sợi kép ADN kết thúc bằng hai nucleotide liên kết bổ sung với nhau. • ADNc (complementary DNA): phân tử ADN bổ sung được phiên mã từ ARNm bằng enzym phiên mã ngược. ADNc không chứa intron, chỉ gồm exon so với ADN (gen) ở trong hệ gen (genome). • centromere: tâm động. Là đoạn nhiễm sắc thể tại đó hai nhiễm sắc tử dính vào nhau trong phân bào nguyên nhiễm. Tâm động là vị trí để phức protein kinetochore bám vào và tương tác với các sợi thoi...

10p poseidon02 18-07-2011 216 58   Download

Một số vấn đề của sinh học phân tử Võ Thị Hương Lan NXB Đại học quốc gia Hà Nội 2007. 181 tr. Từ khoá: ADN, GEN, genome, nhiễm sắc thể, ty thể, lục tạp, geomic, ADN, tái tổ hợp, ngân hàng các ADNc, cDNA, ADN genome , phản ứng PCR, kỹ thuật gen, phương pháp lai, Protein, tổng hợp protein, vận chuyển protein, tín hiệu tế bào, truyền tín hiệu tế bào, Thụ thể tyrosine kinase, Protein G, sinh trưởng, phát triển, hệ gen lưỡng bội, phôi, chu trình tế vào, phân chia tế bào. Tài liệu trong Thư viện...

19p poseidon02 18-07-2011 649 150   Download